PDB数据库简介

作者&投稿:齐刮 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
PDB数据库网址是什么?~

http://www.uniprot.org/
新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元。这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人
员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费获取信息。(新浪网 2002年11月01日)
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传,在网上,它们可以通过PBD的会员组织(PDBe, PDBj, RCSB)免费获取。PDB是由一个叫做世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank, wwPDB)管理。PDB是结构生物(如结构基因组学)的一个关键性资源。大部分学术刊物,以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院(NIH)],现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB
 从PDB的网站上,可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构,并可以将这个结构图下载到电脑中,通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。   从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。

PDB是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。可以使用PalmReader打开。 如果想把PDB文件转换成TXT文件查看,可以使用WavePDB转。
  程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。常见的VC80.PDB(更笼统地说就是 VCx0.PDB,其中 x 表示 Visual C++ 的版本。) 该文件存储各个 OBJ 文件的所有调试信息并与项目生成文件驻留在同一个目录中。

谁知道VC产生的程序数据库 (PDB) 文件有什么用?什么时候用?怎么用...
答:使用 /Zi 选项编译的对象 (.obj) 文件包含程序数据库 (PDB) 的名称。不将对象的 PDB 文件名指定给链接器;如果需要,LINK 使用嵌入的名称查找 PDB。这同样适用于库中包含的可调试对象;可调试库的 PDB 必须可用于链接器和该库。LINK 还使用 PDB 保存 .exe 文件或 .dll 文件的调试信息。程序的 ...

...想问一下一个名词,什么叫“蛋白质三级结构的数据库”?
答:蛋白质三级结构数据库是《生物信息学》里面的内容。简单来说就是已知一段氨基酸序列的空间构象(三级结构),若另一蛋白质分子中含有这段氨基酸序列,就可以大致推断这个蛋白质的空间构象(三级结构),而由这些已知的氨基酸序列的三级结构构成的库就是相应的数据库_蛋白质三级结构数据库。也就是说如果将一...

如何对接oracle 建立pdb
答:Oracle数据库的结构是一个数据库实例下有许多用户,每一个用户有自己的表空间,即每一个用户相当于MySQL中的一个数据库。不久前下了oracle 12c的数据库,安装之后建user时才知道oracle12c 有一个很大的变动就是引入了pdb可插入数据库,而且在cdb中只能创建c##或者C##开头的用户,只有在pdb数据库中才能...

ASP.Net 中.PDB, .DLL 文件是数据库文件还是...?使用方法是怎样?这两个...
答:.pdb文件可以忽略,这个没用,.dll文件是编译产生的动态库文件,这个必须有,这两个文件和Sqlserver一般没用关系,除非你在页面后台文件(.cs)中写了数据库连接字符串,不过一般的都是把数据库连接串放在web.config文件的connectingstring配置节中

用powerdesiner建模后生成的PDM,PDB,CDM,CDB这几个是什么关系,有什么区 ...
答:PDM 是物理模型图(数据表)CDM是概念模型图 PDB,CDB是编译生成的动态链接库 pdm可以由cdm生成,一般设计数据库的时候,都是先设计概念模型cdm然后通过概念模型生成物理模型pdm.

转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思
答:NR库属于非冗余蛋白序列数据库,是NCBI官方的蛋白序列数据库,数据来源于GenPept、SwissProt、PIR、PDF、PDB以及NCBI RefSeq,是默认的蛋白比对数据库。NT数据库是美国国家生物技术信息中心NCBI官方的核酸序列数据库,NT库属于非冗余核酸序列数据库,数据来源于GenBank、EMBL 以及 DDBJ,是NCBI默认的核酸blast...

pdb的文件头名
答:} DatabaseHdrType;文件头字段描述:Name 一个32字节的长度的字符串,包含有数据库的名称。名称最长为31个字节,使用0x00结尾。该字段也用来在同步备份时作为PDB文件的文件名。Attributes 数据库的属性标志。Version 数据库的版本。creationDate 数据库创建日期,为距离1904年1月1日上午12:00的秒数。Mod...

oracle 11g 和 12c 有什么区别?
答:oracle11g在DBA管理上较完善,提升了对数据库的管控能力,且提供了许多自动特性,相对来说oracle11g升级较为简单,而oracle12c则相较于oracle11g没有这么平滑。3、新特性。oracle12c的新特性是实现云数据库的支持,提供云平台管理,这是oracle11g所没有的功能,同时oracle12c增加了CDB和PDB的概念,功能较...

PDB数据库怎么样
答:用过,如果对市场数据不是要求很高的话也没必要订这个数据库。主要查市场数据

如何配置Hibernate连接oracle12c 的PDB和CDB数据库
答:如何配置Hibernate连接oracle12c 的PDB和CDB数据库 启动根容器:[oracle@eric ~]$ export ORACLE_SID=cup [oracle@eric ~]$ sqlplus / as sysdba SQL*Plus: Release 12.1.0.2.0 Production on Wed Jan 21 16:00:06 2015 Copyright (c) 1982, 2014, Oracle. All rights reserved.Connected ...