各位大虾，请问在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子？

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事实上，在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子，当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下：

1.在Gene数据库，填入基因名HNF-4，我一般的话习惯叫Symbol，每个基因都有个Symbol，即基因名。

2.我们来mouse的HNF4基因来作为今天的例子。Symbol会随着版本的升级而变化，当然，以前使用过的基因名也会保留着。而Symbol会对应一个GeneID，无论Symbol如何改变，GeneID是唯一的。这个ID是非常重要的。在这个页面，我们将看到HNF4基因的结构图，从图中给出的信息可以看出，HNF4基因有10个外显子。蓝色部分是UTR区，显示在5’端有一小段序列和3’端有一大段序列是UTR。

3.在HNF-4基因的RefSeq区域，我们将可以看到这个基因的参考序列，有mRNA和基因组的。这个区域不一定每个基因都有。NM_开头的序列都是参考序列。

4.接下来我们进入Splign的online界面，你可以通过mRNA和基因组的Accession或是它们Fasta格式的序列进行对比，要注意基因组的序列不要太长。推荐直接在下拉框选项里选择，一般常用的生物都在。

5.结果一目了然，10个外显子，而且还显示mRNA以及对应的基因组比对的序列，并且还可以知道某个外显子在mRNA序列上的区域。就连UTR区的序列也知道了。

现到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene

然后输入ABL[sym] ，代表你是在查找ABL为缩写符号的基因
就会得到
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=ABL[sym]
第一个就是人类ABL基因，再点开，得到

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/25
该基因位于第9号染色体130713881..130887675。

下拉到第三栏灰色条“Genomic regions, transcripts, and products”，点击偏右侧的，Go to nucleotide: 最后那个GenBank

得到
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000009.12?report=genbank&from=130713881&to=130887675

向下拉，你会看到 gene 1..173795就是说该基因全长

然后是mRNA, 你会看到有11段数值，这就是该基因11个外显子的位置。同理，CDs，就是11个外显子的编码区域了。

具体的序列，你在下面根据数值段就可以得到了。

使用NCBI查找基因序列教程

谁知道怎样在NCBI中找数据库?
答：因此NCBI 的分类学数据库不是一个系统发育或分类学的“专家数据库”（Wheeler et al., 2000）。获取序列所对应的分类学信息有两种方法。一种方法，从NCBI 网站下载gi与taxid 对应表，在Taxonomy 数据库的FTP 地址下载。这个目录下有多个压缩文件，其中针对Windows 操作系统的两个针对蛋白质序列和核苷酸...

怎么在ncbi查找犬类的全基因组
答：网页链接 在ncbi页面搜索，左边选择genome, 右边输入你的物种名，搜索，会出现一个页面，上面显示相关物种的进化树，点开你需要的物种名，出现相关信息，点击其在ncbi的序列号，就可以看到基因组信息了，前提是有这个物种的全基因组信息。详细如下图 ...

在NCBI中怎么用已知的引物找目的基因(微生物)
答：在NCBI中需要选核算那个选项，然后写出微生物英文缩写名称，另外最好写上该基因片段名称。点击搜索即可。会搜到很多基因，找几个典型的基因，然后复制到txt文档里，用DNAStar的editseq来查询已知引物所在位置。不懂继续问。还望采纳哈~

怎么在ncbi上查找一个基因的显性
答：打开后在Search中选择Nucleotide 再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名 以缩小范围.

在ncbi上怎么查参考文献的页码
答：登录平台，点击“搜索”选项框。在下方的搜索框中输入英文期刊名称，然后点击右边的搜索图标页面会出现该英文期刊的封面及网址，点击该期刊对应的网址。

怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列
答：3 进入NCBI的Blast服务页面，http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 在basic blast部分，你有两个选择：1）protein blast->搜索蛋白质序列；2）tblastN->搜索核酸序列。4 进入程序搜索页面，将Swissprot的登录号P38426贴如输入框。5 再下面就是如何使用Blast。6 在Blast的结果中，你可以根据序列...

如何在NCBI上查找某个基因在染色体的位置,例如显示出在第几号染色体...
答：在NCBI网站，选择OMIM（PUBMED下面），输入基因名称，你会获得许多关于该基因的信息，其中就包括染色体定位。

求教怎么看NCBI的基因图
答：2. 根据已经获得的基因的相关信息进行查找，打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search后面的下拉框中选择Gene，然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”，点击GO。搜索结果出来了，点击箭头所指的Limits, Limits的意思其实就是高级检索，你可以在这里对检索词进行很多限制，这样能大大精简查询结果。我们...

你好,请问你知道怎么在ncbi上找到相似性较低的序列?
答：以blastn为例，这个选项，选第二或第三个 然后页面最下方的Algorithm parameters Max target sequences选大一点，默认值是100，选250/500应该够用了，免得相似性低的序列搜不出来

怎样在NCBI进行相似性搜索?(最好有例子图片)
答：要做相似性搜索，需要用到blast（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）在线比对工具。如果有一条DNA序列，可以做blastn，blastx，tblastx比对；寻找和此DNA相似性高的DNA或蛋白质。如果有一条蛋白质序列，可以做blastp，tblastn比对，寻找和此蛋白质相似性较高的蛋白质或DNA。图示blastp ...